Ducati Panigale đã dùng động cơ mới desmosedici V4, dung tích 1.103 cc. Động cơ V4 được thừa hưởng hầu như toàn bộ công nghệ từ mẫu xe đua thể thức GP, với hệ thống phun biến thiên cùng tủ số mén cục cao 14,1 làm tăng hiệu suất động cơ
Một chất bịt kín đặc biệt đã thay thế các gioăng truyền thống được phân phối bởi một thiết bị bằng laser
Đây là một trong nhưng hoạt động quan trọng nhất trong úa trình lawos ráp của một động cơ hiệu suất cao như Ducati V4
So sánh động cơ V4 với động cơ Ducati Desmosedici MotoGP 2015. Bên trái là hình ảnh động cơ Ducati Desmosedici MotoGP 2015: bố cục khối hình trụ 42 độ, đường kính 81mm. Bên phải là hình ảnh động cơ V4
Động cơ Panigate V4 và Panigale 1299 được đặt cạnh nhau, về kích thước động cơ V4 vẫn nhở hơn một chút
Đây là động cơ Ducati sản xuất đầu tiên có vỉ ngang. Các xi-lanh của V4 90 độ được sắp xếp theo bố cục chữ "L" để đảm bảo khả năng làm mát tối ưu
Hình ảnh nửa dưới của khung động cơ
Động cơ này chỉ nặng hơn 2,2kg so với L-twin trong chiếc Panigale 1299. Nó đã được xoay ngược lại 42 độ, dược đặt ở vị trí tối ưu trong khung xe và được sử dụng như một phần cấu tríc của khung xe